课程文献中心 更多>>

关键词： mirror-image protein   chemical protein synthesis   mirror-image phage display   protein de novo design  

摘要： Mirror-image peptides and proteins composed entirely of D-amino acids have emerged as promising therapeutic candidates owing to their resistance to proteolysis and reduced immunogenicity. Mirror-image phage display (MIPD) is currently the main experimental technique for identifying mirror-image peptide ligands targeting disease-related proteins. However, the success of MIPD critically depends on synthetic mirror-image target proteins, which cannot be produced by traditional recombinant methods due to the intrinsic chirality of biological systems. Recent advances in chemical protein synthesis, such as enzyme-cleavable solubilizing tags, backbone-installed split intein-assisted ligation, and removable glycosylation modification-assisted folding strategies, have effectively addressed key challenges in preparing these complex mirror-image proteins. In addition, computational approaches, exemplified by AI-driven protein design, have become powerful complementary tools, accelerating the discovery and optimization of mirror-image protein drug candidates. Although mirror-image protein drugs have not yet reached clinical use, ongoing innovations in chemical synthesis and ligand screening methods are steadily advancing their therapeutic potential toward clinical translation.

关键词： 枣   热休克蛋白   基因克隆   基因表达分析  

摘要： 植物在逆境环境或发育特殊时期表达的热休克蛋白能够帮助抵抗逆境并且保护植物细胞。文章以田间种植木枣、狗头枣、圆酸枣、V1、V2、V3及木枣不同组织、不同时期枣果为试验材料，从脆熟期枣果中克隆获得HSP基因，采用生物信息学方法分析其序列特征，并通过RT-qPCR分析其时空表达模式。结果显示，木枣HSP基因的cDNA序列长度为478 bp，编码154个氨基酸，推测分子量大小为17.29 kDa，等电点为12.22，呈碱性，蛋白质不稳定系数为81.04，平均亲水性数值为-0.308，为亲水性蛋白，脂肪族氨基酸指数为75.45，蛋白亚细胞定位预测该基因编码的蛋白质位于叶绿体。时空表达模式分析表明，HSP基因在抗裂性好的品种中表达量低、叶片中表达量高、易发生裂果的脆熟期表达量高，裂果发生后表达量呈明显下降。枣HSP基因在变异系V1、木枣叶片、脆熟期枣果中表达量较高。

关键词： 黄芪多糖   氧糖剥夺/复氧模型   BV2小胶质细胞   脂多糖(LPS)   Toll样受体4(TLR4)/核转录因子-κB(NF-κB)信号通路  

摘要： 目的：探讨黄芪多糖（APS）调节Toll样受体4（TLR4）/核转录因子-κB（NF-κB）信号通路对氧糖剥夺/复氧模型（OGD/R）中BV2小胶质细胞极化的影响。方法：建立BV2小胶质细胞的OGD/R损伤模型，脂多糖（LPS）诱导神经炎症损伤，予以APS干预。使用细胞计数试剂盒-8（CCK-8）法检测细胞活力；倒置显微镜观察细胞形态；格里斯硝酸盐检测法（Griess法）检测细胞上清中一氧化氮（NO）含量；酶联免疫吸附（ELISA）测定肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-10（IL-10）、白细胞介素-4（IL-4）的分泌水平；免疫荧光法检测钙离子结合接头蛋白分子-1/诱导型一氧化氮合酶(Iba-1+/iNOS+)和钙离子结合接头蛋白分子-1/精氨酸酶1(Iba-1+/Arg1+)的双阳性率及核因子κB p65（NF-κB p65）的入核率；蛋白免疫印迹法（Western bLot）检测Iba-1、iNOS、Arg1、TLR4、NF-κB p65蛋白表达水平。结果：OGD/R损伤模型中，与空白组比较，OGD/R组的BV2小胶质细胞活化并呈现阿米巴样改变，NO、TNF-α、IL-6分泌水平显著提高（P<0.01），Iba-1+/iNOS+双阳性表达率、Iba-1、iNOS蛋白表达显著提高（P<0.01），NF-κB p65入核率、TLR4、NF-κB p65蛋白表达显著升高（P<0.01），IL-10和IL-4含量显著下降（P<0.01），Iba-1+/Arg1+双阳性表达率、Arg1蛋白表达显著降低（P<0.01）；与OGD/R比较，APS组(0.4g·L-1)细胞活化减少，NO、TNF-α、IL-6分泌水平显著下降（P<0.01），Iba-1+/iNOS+双阳性表达率、Iba-1、iNOS相对蛋白表达显著降低（P<0.01），NF-κB p65入核率、TLR4、NF-κB p65蛋白表达显著下降（P<0.01），IL-10和IL-4含量显著提高（P<0.01），Iba-1+/Arg1+双阳性表达率、Arg1蛋白表达显著增加（P<0.01）。在LPS诱导的神经炎症模型中，与空白组比较，LPS组细胞活化增加，NO、TNF-α、IL-6含量、Iba-1+/iNOS+双阳性表达率、NF-κB p65入核率、Iba-1、iNOS、TLR4、NF-κB p65蛋白表达显著提高（P<0.01），IL-10和IL-4水平、Iba-1+/Arg1+双阳性表达率、Arg1蛋白表达显著下降（P<0.01）；与LPS组比较，APS组细胞活化减少，NO、TNF-α、IL-6含量、Iba-1+/iNOS+双阳性表达率、NF-κB p65入核率、Iba-1、iNOS、TLR4、NF-κB p65蛋白表达显著降低（P<0.01），IL-10和IL-4水平、Iba-1+/Arg1+双阳性表达率、Arg1蛋白表达显著升高（P<0.01）。结论：APS可能通过抑制TLR4 / NF-κB信号通路激活，减少小胶质细胞的活化并促进其向M2型极化，从而减轻OGD/R后产生的神经炎症反应。

关键词： 蛋白质-EGCG复合物   结合方式   蛋白质种类   抗氧化活性   抗衰老活性   相关性研究  

摘要： 本文以蛋白质（大豆分离蛋白、酪蛋白、鸡蛋清白蛋白和β乳球蛋白）和表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）为原料，分别采用混合搅拌、偶联、羟自由基和酶促反应等方法，制备出1种蛋白质-EGCG非共价物和3种共价物。以EGCG结合率、体外抗氧化和衰老酶抑制率等为评价指标，探讨蛋白种类和结合方式对蛋白质-EGCG复合物结构和体外活性的影响，构建蛋白质-EGCG共价物消化过程中体外活性和结构稳定性的相关性。结果显示，蛋白质-EGCG复合作用可增加EGCG的自由基（DPPH·和OH·）清除能力和衰老酶（酪氨酸酶和弹性蛋白酶）抑制作用，具体效果因蛋白质种类和结合方式而不同；酪蛋白-EGCG复合物结合EGCG量最高（0.175-0.225 mg/mg pro），但其体外活性却整体上弱于同结合模式下的大豆分离蛋白-EGCG复合物；羟自由基反应能显著增加蛋白质-EGCG非共价物的体外活性，使其DPPH·清除率和酪氨酸酶抑制率分别提升了86.73%和49.12%以上，而酶促反应和偶联反应却起到相反的作用。蛋白质-EGCG复合物体外活性与其EGCG结合量无显著关系，可能与其结构稳定性相关。大豆分离蛋白-EGCG羟自由基共价物的消化稳定性较差（EGCG结合量为0.06-0.15 mg/mg Pro），却展现出较好的体外抗氧化活性，一定程度上证实了蛋白质-EGCG复合物体外活性与其结构稳定性的反相关性。

关键词： 牛肉丸   罗望子多糖   冻藏品质   冷冻  

摘要： 为探究罗望子多糖（tamarind seed polysaccharide，TSP）添加量对牛肉丸冻藏过程中品质特性的影响，本研究采用液体速冻技术，系统分析了不同TSP添加量（0%、0.5%、1%、1.5%、2%，w/w）对牛肉丸在冻藏期间解冻损失、持水力、质构特性、色差、挥发性盐基氮（TVB-N）、硫代巴比妥酸值（TBARS）、盐溶性蛋白含量及感官评价等指标的影响。结果表明，TSP的添加可显著改善牛肉丸的冻藏品质，其中1%为最佳添加量。冻藏期间，各组牛肉丸的解冻损失率、TVB-N含量和TBARS值增加，持水力和盐溶性蛋白含量降低，色差和质构特性亦受到不同程度影响。冻藏至120 d时，1% TSP组的解冻损失率、TVB-N含量和TBARS值分别较对照组低39.73%、41.18%和8.91%，其持水力和盐溶性蛋白含量较对照组高14.67%和12.82%。并且1% TSP组的香气、色泽、味道、组织状态及口感均为最优。该研究为利用多糖类添加剂提升冷冻肉制品的冻藏保鲜效果及延长货架期提供了理论依据和技术参考。

关键词： 乳酸   乳酸化修饰   肿瘤   表观遗传调控  

摘要： 乳酸是肿瘤微环境中的关键代谢产物，其生物学功能已从传统的代谢副产物转变为调控肿瘤多维度进展的核心分子。蛋白质乳酸化修饰（包括组蛋白和非组蛋白乳酸化）通过表观遗传调控、代谢重编程、免疫微环境重塑等多重途径促进肿瘤恶性转化。在肿瘤起始阶段，乳酸化修饰可激活原癌基因、抑制抑癌通路、增强糖酵解酶活性并形成代谢-表观遗传正反馈环路；在进展阶段，则通过调控上皮-间质转化（epithelial-mesenchymal transition，EMT）、诱导免疫抑制微环境及增强DNA修复等方式，促进肿瘤侵袭转移和治疗抵抗。本文系统综述乳酸化修饰在肿瘤发生、发展及治疗抵抗中的作用机制，并探讨了靶向乳酸化通路在肿瘤治疗中的潜在应用价值。

关键词： 结直肠癌   结直肠癌干细胞   CD133   靶向免疫治疗  

摘要： 结直肠癌（CRC）是全球高发恶性肿瘤，其转移、复发、耐药为临床治疗带来了挑战。结直肠癌干细胞（CCSCs）因具有自我更新和肿瘤启动能力，被认为在CRC进展中发挥着关键驱动作用。CD133是CCSCs中研究最广泛的表面标志物之一，其表达与CRC的侵袭、转移及不良预后密切相关。近年来，靶向CD133+CCSCs的免疫治疗策略逐渐成为CRC精准医疗的研究焦点。本文综述CD133+CCSCs在CRC进展中的作用机制、介导的肿瘤微环境和免疫逃逸机制，以及靶向CD133+CCSCs的免疫治疗新策略。笔者认为未来研究应重点关注以下两方面：CD133异构体与糖基化修饰的诊疗潜能以及利用单细胞测序解析的CCSCs异质性，以期为CRC患者开发个性化治疗策略提供分子基础。

关键词： 海蜇   营养品质   氨基酸   胶原蛋白   品质育种  

摘要： 为比较辽宁丹东和营口地区池塘养殖海蜇的营养品质差异，采用生化分析方法对两地区海蜇伞部、性腺、环肌、肩板和口腕等5个组织的基本营养成分、氨基酸及胶原蛋白含量进行比较分析。研究结果表明：海蜇伞部灰分含量最高（62.19±6.44）%，粗蛋白含量最低（13.87±0.77）%，与其他组织差异显著（P＜0.05）；海蜇环肌粗蛋白和粗脂肪含量最高，分别为（48.55±1.45）%和（10.19±2.03）%；性腺总糖含量最高，为（3.82±0.45）%；与营口地区相比，丹东地区海蜇伞部、环肌及肩板粗蛋白含量高（P＜0.05），而口腕粗蛋白和总糖含量低（P＜0.05）。海蜇各组织氨基酸以谷氨酸、甘氨酸及天冬氨酸为主，两地区海蜇各组织间氨基酸含量无显著差异（P＞0.05）。海蜇胶原蛋白含量为1.35%～13.09%，口腕和肩板胶原蛋白含量显著高于其他组织（P＜0.05），而两地区海蜇各组织间无显著差异（P＞0.05）。研究结果表明，海蜇是优良的蛋白质来源，氨基酸组成合理，胶原蛋白丰富，辽宁丹东和营口地区海蜇各组织之间的营养品质差异大于地区间的差异。本研究结果为海蜇的品质育种及精细化加工提供了重要的基础数据支撑。

关键词： 姜黄   法尼醇脱氢酶基因   生物信息学   萜烯合酶   原核表达  

摘要： 姜黄倍半萜合酶法尼醇脱氢酶基因(ClFLDH)是萜类化合物合成途径中的关键限速酶。为探讨提高姜黄萜烯类化合物产量，该研究通过同源克隆获得ClFLDH的cDNA序列，其开放阅读框(ORF)为855 bp，编码295个氨基酸。生物信息学分析表明，ClFLDH蛋白的相对分子量为31 kDa，等电点为6.79，为脂溶性疏水中性蛋白。构建pCE32a-FLDH原核表达载体，并在大肠杆菌DH5α中进行表达分析，重组菌株的SDS-PAGE电泳检测结果表明目的蛋白大小为37 kDa。GC-MS分析表明，ClFLDH蛋白可能催化3，5-二甲氧基苯酚生成[1，2-a]吡嗪-1，4-二酮，6H-3-(苯甲基)-吡咯。这为深入理解姜黄萜类化合物合成的调控机制提供了新的视角，也为通过基因工程手段提高姜黄萜烯类化合物产量奠定基础。

关键词： Chemistry   biochemistry (chemical biology)  

ISBN: (数字)9783527842346 ISBN: (纸本)9783527352159

摘要： Harness the power of machine learning for quick and efficient calculations of protein structures and properties Machine Learning in Protein Science is a unique and practical reference that shows how to employ machine learning approaches for full quantum mechanical (FQM) calculations of protein structures and properties, thereby saving costly computing time and making this technology available for routine users. Machine Learning in Protein Science provides comprehensive coverage of topics including: Machine learning models and algorithms, from deep neural network (DNN) and transfer learning (TL) to hybrid unsupervised and supervised learning Protein structure predictions with AlphaFold to predict the effects of point mutations Modeling and optimization of the catalytic activity of enzymes Property calculations (energy, force field, stability, protein-protein interaction, thermostability, molecular dynamics) Protein design and large language models (LLMs) of protein systems Machine Learning in Protein Science is an essential reference on the subject for biochemists, molecular biologists, theoretical chemists, biotechnologists, and medicinal chemists, as well as students in related programs of study.