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关键词： AF2   提示词工程   多构象采样   动力系统控制   同源序列扰动  

摘要： AlphaFold2作为首个达到实验精度的深度学习蛋白质结构预测模型,已成为结构生物学领域的核心工具.与此同时,由此衍生的深度学习方法在蛋白质构象系综的高效采样及蛋白序列设计、配体扩散生成等一系列从蛋白质结构出发的下游结构生物学方向中也取得了长足进步.在多构象采样方面,传统分子动力学和蒙特卡罗方法 因计算成本和采样效率限制,难以在较大体系中广泛应用,现有生成式深度学习方法能快速得到蛋白质多构象结构,但难以加入适当约束以控制构象采样的范围.此外,蛋白质初始结构的鲁棒性对基于蛋白质结构的下游模型表现和分子动力学模拟的效率至关重要,但传统的蛋白质结构修复工具在修复蛋白结构缺失区域方面效果有限.针对这些挑战,本研究提出FoldCopilot套件,基于AlphaFold2将目标序列和多序列比对结果作为Evoformer模块的提示词输入,结合同源序列扰动机制,无需重新训练即可生成多样化的局部构象.此外, FoldCopilot利用模板与结构初始化帧,通过结构预测模块的迭代过程实现了对模型生成结构的演化与控制.实验结果表明,该方法在蛋白质结构修复和局部多构象生成等任务中表现出色,为蛋白质-分子相互作用预测和结构建模提供了新的思路,并为后续的分子动力学模拟和生物学研究提供了强有力的支持.

关键词： Foliar spraying with selenium fertilizer   Macadamia   Selenium   Free amino acid  

摘要： The elite Macadamia cultivar,‘Guire 1’,as experimental material,was treated with selenium fertilizer via foliar spraying at various growth stages.The selenium content and free amino acid composition in macadamia nuts of different selenium fertilizer treatments were measured and analyzed.The findings indicated that foliar application of selenium fertilizer effectively enhanced the accumulation of selenium in the kernels of macadamia nuts.The time of foliar application of selenium fertilizer significantly influenced the effective accumulation of selenium in kernels.Notably,foliar application during the full-bloom stage resulted in significantly higher accumulation than that at other stages.Principal component analysis(PCA)was employed to develop a comprehensive evaluation model for the effective accumulation of selenium in kernels from different treatments.The model indicated that the optimal comprehensive quality of free amino acids was attained when the selenium accumulation in kernels reached 0.223 mg/kg.The reliability and validity of the evaluation model were further corroborated through stepwise regression analysis.This study provided theoretical and practical foundations for improving macadamia quality traits and established a basis for standardizing selenium fertilization protocols.

关键词： 传染病检测   抗原检测法   抗体检测法  

摘要： 在公共卫生领域,急性传染病,特别是突发急性传染性疾病的流行,时刻威胁着人们的健康,给公共卫生系统带来巨大挑战。而准确有效的传染病快速检测方法,无疑是控制传染病传播的关键“武器”。随着科技的飞速发展,核酸检测法、抗原检测法、抗体检测法成为当下主要的传染病检测手段。这三种检测方法原理不同、适用范围各异,下面就为大家详细解读。

关键词： 伤口愈合   水凝胶   干细胞   细胞治疗  

摘要： 伤口愈合是一项医学挑战,尤其是在慢性伤口治疗领域。传统的治疗方法往往难以满足慢性伤口的复杂需求,如糖尿病足溃疡和深度烧伤。近年来,水凝胶和干细胞技术的结合为伤口治疗带来了新希望。水凝胶以其优异的保湿性、透气性和生物相容性,成为理想的伤口覆盖材料,而干细胞则因其再生和修复受损组织的能力被高度重视。一方面,水凝胶提供了一个三维的支架,模拟伤口部位的自然环境,促进干细胞的吸附、生长和分化。此外,它们可以被设计为递送系统,缓释生长因子或药物,直接作用于治疗部位,加速伤口修复过程。另一方面,干细胞能够通过分泌生长因子和细胞因子等方式,激活周围组织的修复功能,改善局部血液循环,减少炎症反应。本综述旨在探讨水凝胶与干细胞联合应用在促进伤口愈合方面的发展和应用,以期为慢性伤口的临床治疗提供新的思路与策略。

关键词： 甘蔗   ShRPM1基因   克隆   抗病   生物信息学分析   表达特征  

摘要： 【目的】克隆甘蔗ShRPM1基因,并解析基因的结构、性质与表达特征,为甘蔗抗病分子育种提供基因源。【方法】以甘蔗品种‘中蔗1号’为材料,通过RT-PCR克隆ShRPM1基因全长,结合生物信息学工具分析其编码蛋白的理化性质、结构域、亚细胞定位及启动子顺式作用元件;利用qRT-PCR检测甘蔗梢腐病菌胁迫下ShRPM1基因的表达变化。【结果】成功克隆甘蔗ShRPM1基因,cDNA全长为3747 bp,编码1248个氨基酸;其蛋白理论分子量为141.8 kDa,等电点8.62,为亲水性非分泌蛋白,无跨膜结构,主要定位于细胞核。保守结构域分析显示,ShRPM1蛋白含有RX-CC-like、NB-ARC和LRR结构域,属于NLRs家族CNL类抗病蛋白。系统发育树表明其与高粱RPM1蛋白亲缘关系最近。启动子区鉴定到3类抗病相关顺式元件及多个激素应答元件,预示其受病原菌与激素信号调控。qRT-PCR结果显示,ShRPM1基因在甘蔗不同组织中的表达具有明显特异性,其中茎部表达量最高;ShRPM1基因的表达还具有明显的发育阶段特异性,在苗期表达量最高;ShRPM1基因在接种甘蔗梢腐病原菌24 h后,表达量显著上调,表明该基因受病原菌诱导表达。【结论】首次从甘蔗品种‘中蔗1号’克隆获得ShRPM1基因,其编码的CNL类抗病蛋白参与甘蔗抗病响应,为甘蔗抗病分子育种提供新靶点。

关键词： 黄芪多糖   复合益生菌   保育猪   腹泻  

摘要： 为探讨在饲粮中添加黄芪多糖联合复合益生菌对保育猪腹泻防治的影响,为黄芪多糖和复合益生菌在保育猪生产中的应用提供依据。本试验选择240头体重接近、体况良好的30日龄保育猪,随机分为4个处理组,每组3个重复,每个重复20头。对照组(CK)饲喂常规饲料、A组的饲料中添加了0.2%的复合益生菌和0.1%的黄芪多糖、B组的饲料中则添加了0.4%的复合益生菌和0.2%的黄芪多糖、C组的饲料中添加0.6%复合益生菌和0.3%黄芪多糖。测定保育猪平均日采食量、平均日增重及料重比,每日记录死亡数,试验结束时计算成活率,每日记录腹泻头次数,试验结束时计算腹泻率。结果表明:保育猪基础日粮中添加黄芪多糖联合复合益生菌,可显著增加体重、平均日增重和平均日采食量,降低料重比和腹泻率,其中添加0.4%复合益生菌+0.2%黄芪多糖的保育猪生长性能最佳,腹泻率最低。因此,推荐在保育猪生产中,在基础日粮中添加0.4%复合益生菌+0.2%黄芪多糖。

关键词： 类受体蛋白激酶   AtORPK1   拟南芥   原核表达   多克隆抗体  

摘要： 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase, LRR-RLK)是一类富含亮氨酸的单跨膜类受体蛋白激酶,也是植物类受体蛋白激酶家族中最大的亚家族。本研究通过分段克隆LRR-RLK家族的氧化应激相关蛋白基因(oxidative-stress related protein kinase 1,AtORPK1)编码序列构建原核表达载体,转化至大肠杆菌BL21,经IPTG诱导获得重组蛋白,并纯化出可溶性的AtORPK1蛋白C端。经免疫兔子获得了多克隆抗体,通过免疫荧光和western blot实验验证多克隆抗体与目的蛋白识别的特异性。本研究成功利用大肠杆菌表达了AtORPK1蛋白C端,并获得特异性良好的多克隆抗体,为快速制备植物富含亮氨酸单跨膜类受体蛋白的抗体提供了有效方法;获得的多克隆抗体可用于检测并鉴定目的蛋白在植物中的表达水平,还可用于免疫荧光分析,快速定位目的蛋白在植物细胞和组织中的分布,为研究植物类受体蛋白激酶信号通路的分子机理奠定基础,也为黄河流域盐碱地抗逆植物的分子育种提供参考依据。

关键词： 间充质干细胞   细胞分化   机械转导   成骨  

摘要： 在人体中,活细胞和组织会受到物理力和化学刺激的影响,这类通过物理力的作用传递的信号即机械信号。细胞对机械信号的反应在胚胎发育以及组织愈合和修复中起着关键作用。机械信号在指导间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)的谱系分化中发挥着关键作用。本文总结了基质刚度、形状和外部力学等机械信号对MSCs成骨分化中的影响和作用途径以及MSCs在感知和响应其机械环境变化方面的进展,为促进MSCs的成骨分化提供参考,提高MSCs移植修复临床骨缺损的效果。

关键词： 油茶   西方蜜蜂   花蜜   氨基酸   授粉  

摘要： 【目的】植物花蜜中的氨基酸含量会影响蜜蜂的采集偏好,前期研究发现富含花蜜的油茶花对采集蜂缺乏吸引力,导致蜜蜂为油茶授粉增产效率偏低。旨在比较不同油茶品种花蜜中氨基酸的种类与含量,以探明油茶花蜜中的影响西方蜜蜂的氨基酸成分以及其对西方蜜蜂的影响,为提高蜜蜂对油茶的授粉效率提供新思路。【方法】以赣447、长林18和赣68油茶花蜜为研究对象,利用液相色谱质谱联用技术(LC/MS)检测不同品种的油茶花蜜中氨基酸种类和绝对含量;同时评估油茶花蜜中含量最高的氨基酸(L-谷氨酰胺)对西方蜜蜂寿命,免疫和解毒相关基因表达量的影响。【结果】(1)赣447、长林18和赣68油茶花蜜中均含有21种氨基酸中的19种氨基酸,但组分和浓度有差异,其中,赣447、长林18油茶花蜜均未检测到甘氨酸和半胱氨酸,而赣68油茶花蜜中未检测到天冬酰胺和半胱氨酸。(2)3种油茶花蜜中L-谷氨酰胺的含量最高,其中赣447油茶花蜜中高达(1612.63±17.85)mg/kg,3种油茶花蜜中的脯氨酸(Pro)和γ-氨基丁酸(GABA)含量均较低(<100 mg/kg)。(3)与赣447花蜜中剂量相同的L-谷氨酰胺(1610 mg/kg)添加到日粮中对西方蜜蜂工蜂的寿命无显著影响(P>0.05),也不会诱导工蜂的防御素1基因(Defensin1)和抗菌肽基因(Abaecin)2种免疫基因以及细胞色素P450基因(CYP450)、谷胱甘肽-S-转移酶3基因(GSTS3)和过氧化氢酶基因(Catalase)3种解毒基因上调表达。【结论】油茶花蜜中高含量的L-谷氨酰胺不会威胁西方蜜蜂工蜂的生存,而较低含量的脯氨酸和γ-氨基丁酸(GABA)可能是导致油茶花对西方蜜蜂吸引力较弱的原因。

关键词： 翼状胬肉切除   角膜缘干细胞移植   绷带镜   二妥布霉素地塞米松滴眼液  

摘要： 目的探讨单纯翼状胬肉切除术+自体角膜缘干细胞移植术(二联手术)联合绷带镜及妥布霉素地塞米松滴眼液治疗翼状胬肉的疗效。方法选取2021年1月至2023年12月于永春爱尔眼科医院收治的555例翼状胬肉患者为研究对象,随机数字表法分为对照组、绷带镜组、联合组3组,每组各185例。对照组采用常规二联手术进行治疗,绷带镜组在对照组的基础上联合绷带镜治疗,联合组在绷带镜组的基础上予以妥布霉素地塞米松滴眼液治疗。观察术后3组患者的临床疗效、角膜创面愈合时间、结膜充血水肿治愈时间、眼部症状评分、复发情况等。结果治疗后,联合组治疗总有效率高于绷带镜组,绷带镜组高于对照组(P<0.05);联合组角膜创面愈合时间、结膜充血水肿治愈时间均比绷带镜组更短,而绷带镜组短于对照组(P<0.05);治疗7 d后,联合组的眼部症状评分低于绷带镜组,绷带镜组评分低于对照组(P<0.05);术后随访1年结果显示,联合组的复发率低于绷带镜组,绷带镜组的复发率低于对照组(P<0.05)。结论二联手术联合绷带镜及妥布霉素地塞米松滴眼液治疗翼状胬肉的临床疗效显著,优化患者眼部体验,可降低术后复发率,具有一定应用价值。