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关键词： 蛋白质工程   工程化蛋白设计   肿瘤精准治疗   肝胆胰肿瘤  

摘要： 蛋白质工程通过优化和设计蛋白质结构,突破了天然蛋白质在稳定性、靶向性和功能表达等方面的局限,在肿瘤精准治疗中展现出广泛应用潜力。近年来,工程化单克隆抗体、融合蛋白、细胞因子等治疗性蛋白不断发展,显著提升了实体瘤治疗的疗效、特异性和安全性。肝胆胰肿瘤作为一类高致死率的消化系统恶性肿瘤,因高度异质性、免疫抑制微环境及耐药性导致传统疗法疗效有限,而工程化蛋白药物的应用已在科学研究和临床实践中取得积极成效。本文综述了工程化蛋白质的主要设计策略及其在肿瘤精准治疗领域的研究进展,并探讨了其在肝胆胰肿瘤中的应用前景与面临的挑战。

关键词： 氨基酸   糖脂代谢   非酒精性脂肪肝  

摘要： 氨基酸是蛋白质的基本组成单位和重要的代谢信号分子,在糖脂代谢调控中发挥关键作用。研究表明,支链氨基酸(BCAAs)、芳香族氨基酸和含硫氨基酸的代谢紊乱与非酒精性脂肪肝(NAFLD)的发生发展密切相关。BCAAs通过激活mTOR信号通路,诱导氧化应激和线粒体功能障碍,促进胰岛素抵抗和肝脏脂质沉积。此外,亮氨酸缺乏可通过氨基酸感应器GCN2通路增强胰岛素敏感性,减少肝脏葡萄糖生成;而蛋氨酸缺乏则通过FGF21信号调控脂质代谢。临床研究发现,血清BCAAs水平与脂肪肝严重程度显著相关,提示其作为潜在生物标志物的价值。尽管靶向氨基酸代谢的干预策略,例如BCAA限制饮食、支链α-酮酸脱氢酶激酶(BCKDK)抑制剂在改善肝脏代谢方面展现出良好前景,但mTORC1抑制剂等治疗手段的代谢副作用提示氨基酸感知网络的复杂性。临床主要挑战包括:氨基酸代谢网络的动态平衡调控、干预措施的双重性验证,以及个体化治疗反应差异的预测等。未来研究需结合多组学技术,阐明氨基酸感知信号通路的组织特异性机制,开发基于代谢分型的个体化治疗方案,为NAFLD的精准防治提供新思路。

关键词： 嗜黏蛋白阿克曼氏菌   益生特性   全基因组   安全性   功能基因  

摘要： 本研究从新疆不同地域健康人群粪便中分离得到的12株嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila),基于基因组系统发育分析对菌株的遗传差异进行了比较分析。基因组分析显示,分离菌株基因组长度为2.64~2.98 Mb,GC含量为55.1%~55.7%。依据平均核苷酸一致性以及核心基因构建系统进化树,将分离菌株划分为3个亚群。分离菌株耐受实验和表面特性测定结果显示,subgroupⅡ菌株对酸和胆盐耐受性最好,subgroupⅡ菌株在48 h时的自聚集率均在60%以上,15 min后其对二甲苯的疏水性高达(32.00±0.02)%。抗氧化能力分析结果显示,subgroupⅡ菌株对1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基和2,2’-联氮双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)阳离子自由基均表现出更佳的清除能力。溶血实验结果显示所有菌株安全无毒。抗生素耐药性分析结果显示,分离菌株对链霉素、庆大霉素等氨基糖苷类抗生素存在一定程度耐药性,对糖肽类抗生素万古霉素敏感,耐药表型与基因检测不严格对应。基因组测序显示,菌株拥有碳水化合物水解酶(glycoside hydrolase,GH)家族基因GH2和GH20。碳源利用谱分析显示低聚半乳糖、大豆低聚糖、木糖醇等对菌株的增殖具有协同促进作用。总体上,隶属于subgroup II的菌株具有优良的益生特性,后期可作为益生菌重点开发利用。

关键词： 细胞色素   b_(6)f复合物   bc_(1)复合物   血红素   蛋白质  

摘要： 细胞色素的主要功能是参与电子传递,其在植物生命活动中起着重要作用。植物叶绿体中的细胞色素b_(6)f复合物和线粒体中的细胞色素bc_(1)复合物内都含有细胞色素,但各种植物生理学及生物化学高校教材对这些部位相关复合物的结构组成及细胞色素的表述方式存在差异。本文对一些不恰当的表述进行了分析和评价,并提出了修正建议,以供同行交流与参考。

关键词： 灵芝子实体   灵芝多糖   醇沉分级   结构表征   抗氧化活性  

摘要： 以灵芝子实体为研究对象,采用超声提取、分级醇沉获得各级灵芝多糖(GLP40,GLP60,GLP80)。通过高效液相凝胶渗透色谱、红外光谱和离子色谱等方法确定各级灵芝多糖的分子质量、基团特征、单糖组成和抗氧化活性。实验结果显示:GLP40,GLP60和GLP80的分子质量分别为4.691×10^(4),2.050×10^(4),7.440×10^(3) Da;3种灵芝多糖组分均有多糖的特征吸收峰和吡喃型糖环存在;3种灵芝多糖组分均主要由不同物质的量之比的岩藻糖、鼠李糖、阿拉伯糖、半乳糖、葡萄糖、木糖、甘露糖和葡萄糖醛酸组成,具有一定的抗氧化活性,且呈现出浓度依赖性。其中:DPPH自由基清除活性顺序为GLP40>GLP>GLP60>GLP80,GLP40最强,EC_(50)为0.73 mg/mL;ABTS自由基清除活性顺序为GLP40>GLP60>GLP>GLP80,GLP40最强,EC_(50)为0.83 mg/mL;还原力由高到低为GLP40>GLP60>GLP>GLP80,GLP40还原力最强,RP_(0.5AU)为1.22 mg/mL。研究结果可为灵芝资源开发以及多糖结构和活性研究提供参考。

关键词： 糖尿病   脂肪间充质干细胞   皮肤创面   自噬  

摘要： 慢性糖尿病创面是糖尿病患者的常见并发症,是导致患者残疾和死亡的主要原因。自噬作为生物体溶酶体代谢的一种重要形式,在促进创面修复中起着重要作用,而脂肪间充质干细胞来源的外泌体(ADSC-Exo)被认为在生物发生和分子信号机制中与细胞内自噬密切相关。中国医科大学附属盛京医院病理科王哲教授课题组在《Burns&Trauma》杂志发表题为《Adipose mesenchymal stem cell-derived exosomes promote skin wound healing in diabetic mice by regulating epidermal autophagy》的研究性论文。

关键词： 蛋白质结构预测   人工智能   专利分析  

摘要： 随着人工智能技术的不断发展,蛋白质结构预测领域研究取得了重大突破,在药物研发、生物能源、生物材料等众多领域展现出巨大的应用潜力。为了更好地了解全球蛋白质结构预测领域的研究现状,科学推动蛋白质结构预测产业高质量发展,本文基于专利数据,对全球范围内蛋白质结构预测领域的申请态势、区域布局、主要申请人、技术演进、产业发展机遇与挑战等方面进行分析,并重点比较了DeepMind、腾讯等全球主要研究机构的专利布局特点。结果表明,我国蛋白质结构预测领域的专利数量排在世界前列,但核心底层算法、高质量数据和跨学科高端人才与美国相比仍存在差距;新药研发是蛋白质结构预测技术布局应用研发的重点和热点,在合成生物学等其他领域仍有大量空白待填。针对这些问题,提出我国蛋白质结构预测领域的产业发展策略。

关键词： 急性缺血性脑卒中   醒脑开窍   阿替普酶   蛋白质组学  

摘要： 目的 研究醒脑开窍针刺法治疗急性缺血性脑卒中(AIS)阿替普酶溶栓患者的血清蛋白质组学机制。方法 选取AIS阿替普酶溶栓患者60例,采用随机数字表法分为观察组与对照组各30例。对照组给予卒中规范化治疗,观察组在对照组基础上加用醒脑开窍针刺法,检测两组患者血清蛋白质组学差异。结果 治疗后两组美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分显著降低(P<0.05),日常生活活动能力量表(BI)评分显著提高(P<0.05),且观察组NIHSS评分降低程度,BI评分提高程度优于对照组(P<0.05)。血清蛋白质组学检测获取到差异蛋白质125个,其中上调48个、下调77个,主要差异蛋白包括凝血酶原、凝血因子Ⅸ、纤溶酶原、纤维蛋白原α链、载脂蛋白L1等。GO富集分析显示,醒脑开窍针刺法主要参与了中性粒细胞聚集、纤维蛋白溶解等生物学过程,Toll样受体4结合、抗氧化活性等分子功能与纤维蛋白原复合物、钙卫蛋白复合物等细胞成分。KEGG通路富集显示,醒脑开窍针刺法主要调控了轴突再生、Toll样受体信号通路、脂质与动脉粥样硬化等信号通路。结论 醒脑开窍针刺法能够通过多靶点、多通路改善AIS溶栓治疗患者的脂质代谢、氧化应激、炎症反应及凝血功能等状态,提高临床疗效。

关键词： 三阴性乳腺癌   骨桥蛋白   干细胞特性   促血管生成能力   Notch信号通路  

摘要： 目的探究骨桥蛋白(OPN)对三阴性乳腺癌(TNBC)干细胞特性和促血管生成能力的调控作用及Notch信号通路在其中发挥的作用。方法在体外培养人正常乳腺上皮细胞MCF-10A、管腔型乳腺癌细胞MCF-7和TNBC细胞MDA-MB-436的基础上,通过将OPN过表达(OPN-OE)载体转染至MDA-MB-436细胞,构建了稳定过表达OPN的细胞(OPN-OE组),并设立未处理细胞为Control组与空载体转染细胞为Vector组作对照;为探讨Notch信号通路的作用,另增设转染前经γ-分泌酶抑制剂(DAPT)预处理的OPN-OE+DAPT组。随后,通过肿瘤球形成实验评估细胞的干细胞特性,并通过人脐静脉内皮细胞(HUVECs)小管形成实验检测其促血管生成能力;同时,运用蛋白质印迹法检测干细胞标志物(包括分化簇44、分化簇24和乙醛脱氢酶1)以及血管内皮标志物(冯·维勒布兰德因子和分化簇31)的表达水平。结果MDA-MB-436细胞在肿瘤球形成能力及干细胞标志物表达上均最强,其条件培养基诱导的HUVECs小管生成及血管内皮标志物表达也最高,且该细胞中OPN与Notch1蛋白水平显著高于MCF-7与MCF-10A细胞(P<0.05)。发现与Control组和Vector组相比,OPN-OE组肿瘤球形成能力增强、干细胞标志物表达上调,同时促血管生成能力及相关标志物表达也显著提升(P<0.05);而使用Notch通路抑制剂DAPT处理后,上述OPN过表达所增强的干细胞特性与促血管生成作用均被显著抑制(P<0.05)。结论OPN通过激活Notch信号通路增强TNBC细胞的干细胞特性及促血管生成能力。抑制Notch通路可逆转上述效应,提示OPN-Notch轴可能是TNBC治疗的潜在靶点。

关键词： PHB2   牙周炎   炎症因子   NF-κB   LPS   CXCL10  

摘要： 目的阐明抗增殖蛋白2(PHB2)通过调控核因子κB(NF-κB)信号通路介导牙周炎骨组织炎症反应的具体分子机制,揭示其在牙槽骨不可逆吸收这一关键病理过程中的作用。方法本研究通过体内实验,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和免疫组织化学技术(IHC)技术检测牙周炎模型小鼠的牙槽骨组织中炎症因子及PHB2的表达差异。体外实验中,用脂多糖(LPS)诱导小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1炎症模型,通过Western blot和qRT-PCR明确PHB2与炎症因子的调控关系,并观察PHB2亚细胞定位变化。通过分子克隆构建PHB2过表达质粒,用RNA干扰敲低PHB2表达,评估其对炎症反应的调控作用。基于RNA-seq数据,采用基于负二项分布的差异表达分析2(DESeq2)进行差异表达分析,结合京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)功能注释,分析并筛选关键信号通路及差异表达基因。结果在实验性小鼠牙周炎模型中,PHB2在牙周炎组小鼠的牙槽骨组织中的表达量明显上调。在体外细胞炎症模型中,PHB2与白细胞介素(IL)-6、IL-1β和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)炎性因子表达量呈正相关,且随着炎症的发生,PHB2在炎症细胞中的亚定位发生了变化;最后,通过高通量测序检测各组细胞磷酸化p65蛋白(p-p65)表达量变化及上下游基因表达,结果显示,PHB2通过NF-κB信号通路加重了细胞的炎性反应,并且与上游C-X-C基序趋化因子配体10(CXCL10)基因的表达水平有关联。结论PHB2通过NF-κB信号通路加重LPS诱导的牙周炎炎症,为进一步研究牙周炎发生发展过程的分子机制提供了新的研究方向。