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关键词： 翻译起始效率   多尺度卷积   注意力机制   特征融合   生物语义特征  

摘要： 为了提高对于蛋白质翻译起始效率的预测水准并挖掘5端非翻译区(5’untranslated region,5’UTR)序列的隐式语义信息,提出了一种基于多尺度卷积和自注意力机制相结合的预测模型RiboTIEP(ribosome translation initiation efficiency predictor)。该模型通过多尺度卷积层的多维度局部特征提取,以及自注意力机制下的全局特征并行提取,能够有效捕获不同核苷酸组合形式的生物语义特征与序列的上下文依赖关系。在原有单一的特征拼接方法的基础上,引入注意力机制来自适应地分配不同高维特征的权重以实现特征融合,并通过多层感知机进行回归预测。实验结果表明,RiboTIEP模型在多个数据集上的皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient,PCC)均达到了0.88及以上;与单一的CNN模型架构相比,PCC最少可提升4.20%,最多可提升7.86%;与单一的LSTM模型架构相比,PCC最少可提升3.70%,最多可提升44.63%。

关键词： 人脱落乳牙牙髓干细胞   牙囊干细胞   组织再生   口腔疾病   非口腔疾病   治疗   工程化干细胞  

摘要： 背景:人脱落乳牙牙髓干细胞来源于自然替换的乳牙牙髓,具有取材无创、自我更新能力、多向分化潜能、低免疫原性、更接近胚胎特征及不违背伦理要求等优势,是更加理想的种子细胞来源。目的:综述人脱落乳牙牙髓干细胞促进牙齿、牙周及颌骨组织再生的能力以及在口腔和非口腔疾病治疗方面的研究进展。方法:利用计算机检索PubMed、中国知网和万方数据库,中文检索词为“人脱落乳牙牙髓干细胞,再生,治疗”,英文检索词为“human deciduous tooth pulp stem cells,regeneration,treatment”。共检索得到96篇文献,根据纳入与排除标准对文献进行筛选,最终纳入52篇文献进行综述。结果与结论:人脱落乳牙牙髓干细胞比牙髓干细胞、牙囊干细胞和骨髓间充质干细胞在牙齿、牙周及颌骨组织再生方面更具优势。人脱落乳牙牙髓干细胞对口腔疾病包括牙周炎、颞下颌关节炎和干燥综合征有明显的治疗作用,对非口腔疾病包括神经系统、消化系统、心血管系统、泌尿系统、免疫系统、内分泌系统、呼吸系统及精神系统疾病也有较好的治疗效果。

关键词： 慢性萎缩性胃炎   幽门螺杆菌   香砂温中汤   蛋白质组学   NF-κB信号通路  

摘要： 目的采用Label-free定量蛋白质组学技术探讨香砂温中汤治疗幽门螺杆菌(Hp)阳性慢性萎缩性胃炎(CAG)的分子机制。方法纳入37例Hp阳性CAG患者,给予香砂温中汤治疗6个月。治疗前后行胃镜检查,采集胃黏膜组织进行Label-free蛋白质组学分析,Westernblot和ELISA验证关键差异蛋白,评估临床症状、内镜表现、病理改变及Hp清除情况。结果治疗后中医症状积分从18.16±3.95分降至6.43±2.87分(P<0.01),总有效率89.19%。Hp根除率40.54%,载量下降62.55%(P0.01)。内镜下萎缩改善40.54%,OLGA分期改善35.14%。蛋白质组学鉴定4826个蛋白,其中350个差异表达(|log2FC|>1,P<0.05)。关键炎症蛋白NF-κBp65、TNF-α、COX-2分别下降55.68%、60.11%、50.58%(均P<0.01);黏膜保护蛋白BCL-2、MUC5AC分别上升123.53%、97.33%(均P<0.01)。PGI/PGII比值从2.49±0.82升至5.59±1.45(P<0.01)。NF-κBp65表达变化与症状改善呈强负相关(r=-0.724,P0.01)。多蛋白panel预测疗效准确率82.35%。结论香砂温中汤通过抑制NF-B信号通路、下调炎−症因子表达、上调黏膜保护蛋白、促进腺体功能恢复等多靶点机制改善Hp相关CAG,蛋白质组学分析为中药复方作用机制研究和疗效评价提供了新策略。

关键词： 鸡   早幼粒细胞白血病蛋白   单克隆抗体   定位   表达分布  

摘要： 研究旨在研制抗鸡源早幼粒细胞白血病蛋白(PML)的单克隆抗体。试验采用PCR和同源重组技术构建鸡PML基因的1228~1566 nt原核表达质粒,命名为pGEX-6p-1-PML-P2。使用IPTG诱导表达后,以纯化成功的GST-PML-P2蛋白免疫小鼠,将小鼠脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0融合,通过间接免疫荧光(IFA)方法筛选出阳性细胞克隆;用激光共聚焦、Western blot及免疫沉淀(IP)验证单克隆抗体的特性。结果显示:成功获得3株能够分泌抗鸡PML单克隆抗体的杂交瘤细胞株,命名为4C2、3F4和4G3;3株单克隆抗体的亚类均为IgG1,其腹水的IFA效价分别为1∶6400(4C2)、1∶12800(3F4)和1∶25600(4G3);单克隆抗体4C2可特异性检测禽源细胞(HD11、MSB-1、LMH和DF-1)及非禽源细胞(MDCK、MA104和293T)中的内源性PML蛋白,激光共聚焦可观察到DF-1细胞内源性PML蛋白在细胞核内呈点状分布;3株单克隆抗体均能有效免疫沉淀外源高表达的鸡PML蛋白且单克隆抗体4C2能有效免疫沉淀DF-1细胞内源性的PML蛋白,确定PML在鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸腺及法氏囊组织中广泛表达。研究表明,成功制备的3株抗鸡PML单克隆抗体可以有效检测不同细胞系及鸡组织中的PML蛋白并免疫沉淀细胞中内源及外源表达的PML蛋白,为深入探究鸡PML蛋白的功能及其在禽类疾病防控中的应用提供了不可或缺的工具。

关键词： 酵母核苷酸   珍珠龙胆石斑鱼   生长性能   抗氧化能力   肠道免疫能力  

摘要： 为研究酵母核苷酸对珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀×Epinephelus lanceolatus♂)生长性能、形态学指标、抗氧化能力和免疫能力影响,试验采用在基础配方中分别添加0(N0组)、0.5%(N0.5组)、1%(N1.0组)、1.5%(N1.5组)、2%(N2.0组)、2.5%(N2.5组)的酵母核苷酸,制得6组饲料分别投喂初始体质量为(28.85±0.01)g的珍珠龙胆石斑鱼56 d。结果显示:增重率、饲料系数、特定生长率及全鱼水分在各处理组之间无显著性差异(P>0.05)。N0.5、N1.5和N2.0组的存活率分别较N0组提高17.81%、15.07%和16.44%(P<0.05)。五个处理组的全鱼粗脂肪含量较对照组分别提高6.31%、15.62%、13%、6.41%和8.38%(P<0.05),N1.5、N2.0和N2.5组的粗蛋白质含量分别提高2.43%、2.60%和3.04%(P<0.05)。蛋白沉积率在N1.0、N1.5和N2.5组分别提高12.66%、11.70%和9.82%(P<0.05)。脂肪沉积率在N0和N2.0组之间无显著性差异(P>0.05),其他组显著提高(P<0.05)。形态学指标分析表明,随着酵母核苷酸添加量的水平不断提高,均可以显著提高珍珠龙胆石斑鱼的肥满度、脏体比、肝体比、肠体指数和肠长指数(P<0.05),当酵母核苷酸添加量为0.5%~1%时五项指标最高。血清生化指标方面,五个处理组的甘油三酯(TG)、总胆固醇(T-CHO)和尿酸(UA)含量显著低于N0组。TG和T-CHO分别下降36.13%~43.87%、13.19%~38.30%(P<0.05),UA分别下降37.33%~56%(P<0.05)。N1.0组的谷草转氨酶(GOT)活性较N0组下降17.44%(P<0.05),N0.5和N1.0组的谷丙转氨酶(GPT)活性较N0组分别下降5.98%和6.33%(P<0.05)。高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)含量在N1.5和N2.5组分别提高43.75%和59.82%(P<0.05),而低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)含量在各处理组中显著降低(P<0.05)。血清总抗氧化能力(T-AOC)在N0.5、N1.0和N1.5组显著提高(P<0.05),而N2.5组则显著下降(P<0.05)。过氧化氢酶(CAT)活性在N1.0、N1.5和N2.0组分别提高46.42%、47.20%和40.50%(P<0.05)。肠道抗氧化指标显示,N0.5、N1.0、N2.0组肠道T-AOC和超氧化物歧化酶(SOD)活性显著升高(P<0.05)。N1.0组肠道丙二醛(MDA)含量显著降低20.83%(P<0.05)。肠道免疫相关基因分析显示,IL-β、MyD88、NF-κβ-p65和IκBα基因的表达量在N1.0、N1.5、N2.0和N2.5组显著低于N0组(P<0.05),TGF-β基因的表达在N0.5、N1.0和N2.0组分别升高29.13%、24.93%和32.28%(P<0.05)。肠道屏障功能相关基因Claudin-3在N0.5、N1.0、N1.5和N2.0组的表达量显著高于N0组,分别提高46.22%、56.89%、53.78%和70.22%(P<0.05)。N1.0、N2.0组肠道Claudin-12基因相对表达量较N0组分别升高23.25%、35.67%(P<0.05)。综上,饲料中添加酵母核苷酸可以显著改善珍珠龙胆石斑鱼鱼体形态学指标、促进脂质代谢、增强机体抗氧化能力和免疫能力,并改善肠道物理屏障功能。

关键词： 丙型肝炎抗体   肝炎病毒属   试剂盒,诊断   丙氨酸转氨酶   诊断,鉴别  

摘要： 目的 探讨丙型肝炎病毒核酸定量(HCV RNA)和丙型肝炎病毒抗体(抗-HCV抗体)在慢性丙型肝炎(以下简称丙肝)患者病情严重程度评估中的应用价值。方法 按回顾性分析法选取2023年1月至2024年3月我院收治的38例重度丙肝患者,纳入重度组,按照约1∶1.5比例组间基线资料匹配原则,选取同期54例轻中度丙肝患者,纳入轻中度组,对比2组患者的抗-HCV抗体和HCV RNA检测结果,绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析HCV RNA联合抗-HCV抗体检查评估丙肝患者病情严重程度的效能。结果 重度组患者抗-HCV抗体的临界值指数(COI)(19.45±5.62和12.89±3.47)、HCV RNA含量(5.39±1.04和4.28±0.57)均高于轻中度组,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,HCV RNA与抗-HCV抗体检查分别评估丙肝患者病情严重程度的ROC曲线下的面积(AUC)(95%CI)为0.827(0.731,0.922)和0.858(0.776,0.940),灵敏度分别为0.711和0.737,特异度为0.926和0.870,联合评估的AUC(95%CI)为0.914(0.856,0.971),显著高于单一检测(P<0.05),灵敏度和特异度分别为0.763和0.907。结论 HCV RNA联合抗-HCV抗体检查在丙肝患者病情严重程度评估中发挥重要作用,丙型肝炎病毒复制情况与患者病情进展密切相关。

关键词： 黄芪多糖   冷冻干燥保护剂   嗜酸乳杆菌   存活率   细胞完整性   稳定性  

摘要： 黄芪多糖具有多种生理活性功能,其高效利用具有重要意义。该研究以提取纯化的黄芪多糖为原料,并与其他冻干保护剂复配,测定其对嗜酸乳杆菌CICC 22162冷冻干燥的保护效果。结果表明,黄芪多糖组分为64.38%葡萄糖、19.81%半乳糖和15.81%阿拉伯糖,复合保护剂使嗜酸乳杆菌存活率提升至(85.02±1.25)%。扫描电镜显示菌体形态更均匀,相较于传统保护剂,复合保护剂的碱性磷酸酶活性(3450.61 U/g)降低15.5%,乳酸脱氢酶泄漏减少38.7%,溶菌酶敏感性实验中活菌数降幅减少20.6%,NaCl胁迫下膜损伤降低37.2%,组蛋白外泄量减少68%。证明黄芪多糖能更好地维持细胞壁和细胞膜的完整性,减少细胞内容物的泄漏,抵抗外界不利的环境变化。在模拟胃肠消化中菌株存活率达81.3%,较传统保护剂提升33.9%,4℃贮藏120 d后活菌数仍有9.18 lg CFU/mL,制备的冻干菌粉兼具高存活率、强胃肠耐受性和稳定性,研究结果为益生菌制剂提供了创新保护方案,在功能性食品和肠道微生态调节领域具有重要应用价值。

关键词： 菊科蒿属   技术   膳食纤维   蛋白质   胡萝卜素  

摘要： 柳蒿又名柳叶蒿、柳蒿芽,为菊科蒿属多年生草本植物,主要分布于东北、华北北部等地。柳蒿营养价值较高,富含蛋白质、脂肪、碳水化合物及膳食纤维,并含有胡萝卜素、维生素B族和维生素C等多种活性成分[1];同时含有丰富的矿质元素,以钾含量尤为突出,每100 g干品中钾含量约为1 960 mg[2]。在传统医学中,柳蒿具有清热解毒、健脾理气等功效[3]。本文围绕地块选择、整地施肥、播种及田间管理等关键环节进行系统阐述,以期为柳蒿规范化栽培提供技术参考。

关键词： 食用菌多糖   提取方法   结构   抗炎  

摘要： 食用菌多糖是食用菌最重要的活性物质之一,具有多种药理作用,其活性功效与结构密切相关。大量研究表明:食用菌多糖具有显著的抗炎作用,对改善炎症性肠病展现出巨大潜力。综述了食用菌多糖的提取方法及其结构特征,并讨论了食用菌多糖对炎症性肠病的抗炎作用及其机制,旨在为食用菌多糖的加工利用及炎症性肠病的防治提供参考。

关键词： 猪肠道炎症   网络药理学   鬼针草   分子对接  

摘要： 【目的】本研究运用网络药理学与分子对接技术,揭示鬼针草治疗猪肠道炎症的机理,为其作为绿色兽药替代抗生素提供理论依据。【方法】从TCMSP数据库获取鬼针草的有效活性成分;整合GeneCard、NCBI和OMIM数据库中猪肠道炎性相关靶点信息;绘制药物与疾病靶点的韦恩图,并建立共有靶点的蛋白互作网络,对共有靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过STRING数据库筛选核心靶点,并运用AutoDock 1.5.7完成分子对接。为进一步验证上述结果,建立脂多糖(LPS)诱导的猪肠道上皮细胞炎症模型,并通过实时荧光定量PCR检测核心靶点mRNA表达水平。【结果】从TCMSP数据库筛选出4种鬼针草有效活性成分木犀草素、金鸡菊甙、(R)-2-(3,4-二羟基苯基)-6,7-二羟基苯并呋喃-3(2H)-one、槲皮素,并鉴定出与之相关的215个靶点基因。结合疾病数据库,共获得974个与猪肠道炎症相关的潜在靶点,通过筛选分析最终确定了28个核心靶点,其中包括4个关键核心靶点AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、IL-1β。GO功能富集分析共鉴定出327个生物过程、27个细胞组分和60个分子功能条目,揭示了鬼针草可能参与多层次生物学过程。KEGG通路分析结果显示,共获得154条显著富集的信号通路,其中cAMP信号通路、转化生长因子-β(TGF-β)信号通路和PPAR信号通路与猪肠道炎症具有较强相关性。分子对接结果显示,鬼针草有效活性成分与核心靶点具有较强的结合能力。成功建立LPS诱导的猪肠道上皮细胞炎症模型,实时荧光定量PCR验证结果显示,与LPS组相比,鬼针草能下调猪肠道上皮细胞白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等关键靶点的表达水平。【结论】综合网络药理学预测、分子对接及体外细胞试验,本研究系统揭示了鬼针草抗猪肠道炎症的作用机制,其核心在于通过靶向IL-6、TNF-α等关键因子,进而调控cAMP、TGF-β等相关信号通路,形成一个多靶点、多通路的协同调控网络,从而发挥抗炎作用。